MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT8252

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017211	A	6	6	9	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017211	GAA	2	6	54	59	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017211	TGA	2	6	158	163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017211	AG	3	6	178	183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017211	T	7	7	215	221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017211	GAAA	2	8	227	234	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017211	AGTA	2	8	248	255	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017211	T	7	7	267	273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017211	AAGA	2	8	295	302	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017211	T	6	6	303	308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017211	TTAAAT	2	12	310	321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017211	AT	3	6	362	367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017211	TGA	2	6	375	380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017211	TAC	2	6	389	394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017211	T	7	7	429	435	0 %	100 %	0 %	0 %	384183666
16	NC_017211	AT	3	6	438	443	50 %	50 %	0 %	0 %	384183666
17	NC_017211	T	6	6	467	472	0 %	100 %	0 %	0 %	384183666
18	NC_017211	T	7	7	477	483	0 %	100 %	0 %	0 %	384183666
19	NC_017211	T	8	8	510	517	0 %	100 %	0 %	0 %	384183666
20	NC_017211	TTA	2	6	561	566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183666
21	NC_017211	TA	3	6	649	654	50 %	50 %	0 %	0 %	384183666
22	NC_017211	A	6	6	680	685	100 %	0 %	0 %	0 %	384183666
23	NC_017211	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017211	TGA	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017211	A	7	7	771	777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017211	T	6	6	816	821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017211	AT	3	6	924	929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017211	AT	3	6	932	937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017211	TGA	2	6	961	966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017211	A	6	6	966	971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017211	A	6	6	987	992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017211	T	7	7	1013	1019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017211	AG	3	6	1035	1040	50 %	0 %	50 %	0 %	384183667
34	NC_017211	TC	3	6	1068	1073	0 %	50 %	0 %	50 %	384183667
35	NC_017211	TTA	2	6	1108	1113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183667
36	NC_017211	AATA	2	8	1189	1196	75 %	25 %	0 %	0 %	384183667
37	NC_017211	TTTG	2	8	1204	1211	0 %	75 %	25 %	0 %	384183667
38	NC_017211	T	6	6	1223	1228	0 %	100 %	0 %	0 %	384183667
39	NC_017211	GTTA	2	8	1323	1330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017211	AGT	2	6	1334	1339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017211	T	6	6	1349	1354	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017211	TAG	2	6	1404	1409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017211	GTT	2	6	1425	1430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017211	TTCT	2	8	1451	1458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017211	T	6	6	1466	1471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017211	T	7	7	1572	1578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017211	AAT	2	6	1596	1601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017211	ATT	2	6	1610	1615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017211	TA	3	6	1621	1626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017211	TTA	2	6	1648	1653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017211	CAA	2	6	1665	1670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017211	AAT	2	6	1682	1687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017211	TTTA	2	8	1704	1711	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017211	AATA	2	8	1742	1749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017211	TGAA	2	8	1780	1787	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017211	AAT	2	6	1794	1799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017211	T	6	6	1811	1816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017211	A	6	6	1873	1878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017211	TAT	2	6	1883	1888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017211	GTAT	2	8	1919	1926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017211	A	6	6	1949	1954	100 %	0 %	0 %	0 %	384183668
62	NC_017211	AGT	2	6	1959	1964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183668
63	NC_017211	GTC	2	6	2079	2084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384183668
64	NC_017211	AT	3	6	2151	2156	50 %	50 %	0 %	0 %	384183668
65	NC_017211	GAT	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183668
66	NC_017211	AAT	2	6	2177	2182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183668
67	NC_017211	ATG	2	6	2216	2221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017211	TGTT	2	8	2332	2339	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017211	TTG	2	6	2427	2432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017211	ATC	2	6	2446	2451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017211	TGG	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017211	TGA	2	6	2480	2485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017211	A	6	6	2492	2497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017211	T	7	7	2519	2525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017211	TAC	2	6	2563	2568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017211	T	6	6	2630	2635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017211	AG	3	6	2647	2652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017211	CAC	2	6	2683	2688	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017211	T	6	6	2725	2730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017211	GAAT	2	8	2747	2754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017211	TTCTA	2	10	2771	2780	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017211	GAT	2	6	2833	2838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017211	A	7	7	2880	2886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017211	AGT	2	6	2906	2911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017211	A	7	7	2923	2929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017211	A	7	7	2954	2960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017211	TGT	2	6	3006	3011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017211	AT	3	6	3040	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017211	GGA	2	6	3067	3072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017211	ATAC	2	8	3073	3080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017211	CGGA	2	8	3100	3107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017211	ATG	2	6	3124	3129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017211	CGG	2	6	3319	3324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017211	AAAG	2	8	3501	3508	75 %	0 %	25 %	0 %	384183669
95	NC_017211	ATT	2	6	3525	3530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183669
96	NC_017211	GAAC	2	8	3534	3541	50 %	0 %	25 %	25 %	384183669
97	NC_017211	AAAAG	2	10	3570	3579	80 %	0 %	20 %	0 %	384183669
98	NC_017211	AAT	2	6	3593	3598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183669
99	NC_017211	TGT	2	6	3653	3658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183669
100	NC_017211	TTG	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384183669
101	NC_017211	T	6	6	3701	3706	0 %	100 %	0 %	0 %	384183669
102	NC_017211	TGTT	2	8	3743	3750	0 %	75 %	25 %	0 %	384183669
103	NC_017211	T	6	6	3749	3754	0 %	100 %	0 %	0 %	384183669
104	NC_017211	GAGAA	2	10	3769	3778	60 %	0 %	40 %	0 %	384183669
105	NC_017211	A	6	6	3808	3813	100 %	0 %	0 %	0 %	384183669
106	NC_017211	T	6	6	3876	3881	0 %	100 %	0 %	0 %	384183669
107	NC_017211	GAAA	2	8	3932	3939	75 %	0 %	25 %	0 %	384183669
108	NC_017211	AG	3	6	3953	3958	50 %	0 %	50 %	0 %	384183669
109	NC_017211	CAA	2	6	4017	4022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183669
110	NC_017211	AGAA	2	8	4048	4055	75 %	0 %	25 %	0 %	384183669
111	NC_017211	ATAG	2	8	4056	4063	50 %	25 %	25 %	0 %	384183669
112	NC_017211	GATT	2	8	4163	4170	25 %	50 %	25 %	0 %	384183669
113	NC_017211	AGA	2	6	4172	4177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183669
114	NC_017211	TCT	2	6	4206	4211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384183669
115	NC_017211	AAGATT	2	12	4251	4262	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384183669
116	NC_017211	GAT	2	6	4275	4280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183669
117	NC_017211	TA	3	6	4282	4287	50 %	50 %	0 %	0 %	384183669
118	NC_017211	T	6	6	4298	4303	0 %	100 %	0 %	0 %	384183669
119	NC_017211	AG	3	6	4329	4334	50 %	0 %	50 %	0 %	384183669
120	NC_017211	GAAG	2	8	4346	4353	50 %	0 %	50 %	0 %	384183669
121	NC_017211	GAT	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183669
122	NC_017211	TGA	3	9	4499	4507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183669
123	NC_017211	GAA	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183669
124	NC_017211	CAA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384183669
125	NC_017211	GAA	2	6	4582	4587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384183669
126	NC_017211	GA	3	6	4617	4622	50 %	0 %	50 %	0 %	384183669
127	NC_017211	ATT	2	6	4635	4640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183670
128	NC_017211	ATT	2	6	4661	4666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183670
129	NC_017211	AAT	2	6	4720	4725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183670
130	NC_017211	TGA	2	6	4773	4778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183670
131	NC_017211	ATGA	2	8	4831	4838	50 %	25 %	25 %	0 %	384183670
132	NC_017211	GAT	2	6	4924	4929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384183670
133	NC_017211	AAT	2	6	4934	4939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384183670
134	NC_017211	AGG	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017211	TG	3	6	4957	4962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017211	TCTCT	2	10	4965	4974	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017211	ATA	2	6	5011	5016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017211	GTTT	2	8	5058	5065	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017211	A	6	6	5069	5074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017211	T	7	7	5096	5102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017211	TGA	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017211	TTC	2	6	5149	5154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017211	CTA	2	6	5172	5177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017211	CTT	2	6	5199	5204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017211	TTTG	2	8	5272	5279	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017211	AAT	2	6	5315	5320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017211	TGTT	2	8	5368	5375	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017211	TAA	2	6	5398	5403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017211	TA	3	6	5488	5493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017211	TCC	2	6	5519	5524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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189	NC_017211	T	7	7	6933	6939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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212	NC_017211	TAT	3	9	8124	8132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384183673
213	NC_017211	TGAT	2	8	8227	8234	25 %	50 %	25 %	0 %	384183673

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.